Quel que soit leur mode d'utilisation, les huiles essentielles doivent toujours être utilisées diluées, soit dans une huile végétale pour une application sur la peau, soit dans un dispersant pour le bain.
 
L'absorption d'huiles essentielles par voie orale nécessite un avis médical. Pour un usage thérapeutique, consulter un médecin.
 
L'emploi de certaines huiles essentielles est à proscrire pour la femme enceinte ou allaitante. L'utilisation des huiles essentielles par la femme enceinte ou allaitante ne doit se faire que sur consultation médicale.
 
Il est déconseillé d'utiliser des huiles essentielles chez l'enfant de moins de 7 ans, chez les personnes ayant des problèmes de santé, et chez les personnes sensibles ou sujettes à allergies. Pour ces dernières, il est recommandé de faire au préalable un test cutané.
 
Les huiles essentielles sont irritantes pour les yeux. En cas de contact accidentel, rincer l'œil avec une huile végétale (tournesol, olive...).
 
En cas d'ingestion accidentelle, avalez plusieurs cuillères d'huile végétale comestiblec(tournesol, olive...) et contactez un centre anti-poison.
 
Certaines huiles essentielles sont photosensibilisantes, en particulier les essences d'agrumes : ne pas s'exposer au soleil ou aux UV après une application de ces huiles essentielles (citron, bergamote, mandarine, orange et pamplemousse).
 
Toutes les modes d'utilisation ne sont pas recommandées pour toutes les huiles essentielles. Certaines sont irritantes pour les muqueuses et ne doivent pas être diffusées dans l'atmosphère ; c'est le cas des huiles essentielles riches en phénols (thym, origan...). D'autres sont irritantes pour la peau (dermocaustiques) et doivent être diluées à 1% maximum (cannelle, girofle, lemon-grass...).
 
Ne pas employer d'huiles essentielles en cas de traitement médicamenteux sans l'avis préalable d'un médecin.